How much should we sequence? An analysis of the Swiss SARS-CoV-2 surveillance effort.

During the SARS-CoV-2 pandemic, many countries directed substantial resources toward genomic surveillance to detect and track viral variants. There is a debate over how much sequencing effort is necessary in national surveillance programs for SARS-CoV-2 and future pandemic threats. We aimed to investigate the effect of reduced sequencing on surveillance outcomes in a large genomic data set from Switzerland, comprising more than 143k sequences. We employed a uniform downsampling strategy using 100 iterations each to investigate the effects of fewer available sequences on the surveillance outcomes: (i) first detection of variants of concern (VOCs), (ii) speed of introduction of VOCs, (iii) diversity of lineages, (iv) first cluster detection of VOCs, (v) density of active clusters, and (vi) geographic spread of clusters. The impact of downsampling on VOC detection is disparate for the three VOC lineages, but many outcomes including introduction and cluster detection could be recapitulated even with only 35% of the original sequencing effort. The effect on the observed speed of introduction and first detection of clusters was more sensitive to reduced sequencing effort for some VOCs, in particular Omicron and Delta, respectively. A genomic surveillance program needs a balance between societal benefits and costs. While the overall national dynamics of the pandemic could be recapitulated by a reduced sequencing effort, the effect is strongly lineage-dependent-something that is unknown at the time of sequencing-and comes at the cost of accuracy, in particular for tracking the emergence of potential VOCs.IMPORTANCESwitzerland had one of the most comprehensive genomic surveillance systems during the COVID-19 pandemic. Such programs need to strike a balance between societal benefits and program costs. Our study aims to answer the question: How would surveillance outcomes have changed had we sequenced less? We find that some outcomes but also certain viral lineages are more affected than others by sequencing less. However, sequencing to around a third of the original effort still captured many important outcomes for the variants of concern such as their first detection but affected more strongly other measures like the detection of first transmission clusters for some lineages. Our work highlights the importance of setting predefined targets for a national genomic surveillance program based on which sequencing effort should be determined. Additionally, the use of a centralized surveillance platform facilitates aggregating data on a national level for rapid public health responses as well as post-analyses.

Migración en Venezuela, marco normativo e indicadores 2000- 2022 / Migration in Venezuela, regulatory framework and indicators 2000 - 2022

El objetivo fue describir el estado actual del marco normativo de migración, y la tendencia de indicadores de población y migración en Venezuela en el periodo 2000-2022.Métodos: Estudio descriptivo del marco normativo de migración y la tendencia de indicadores de población y migración en Venezuela. Indicadores: población total, tasa de dependencia demográfica (total, niñez, adulto mayor) y tasa de migración. Fuentes de datos: plataforma informativa salud y migración(marco normativo), Anuario estadístico de América Latina y el Caribe año 2000 al 2022 (indicadores de población).Resultados: El marco normativo de la migración en Venezuela está contenido en escasas leyes y Convenios Internacionales y regionales. La variación porcentual en la población venezolana fue descendente durante casi todo el periodo, donde se presentan incluso valores negativos para 2018-2021. La tasa anual decrecimiento poblacional, demostró un descenso constante y marcado desde el año 2000 hasta el año 2018, con altos valores negativos, luego asciende mostrando valores positivos a partir del año 2022, con un valor equivalente al año 2000. Conclusiones: El marco legal migratorio en Venezuela, es deficitario y no acorde a las necesidades de los migrantes. Los cambios ocurridos en la población venezolana de 2000 a 2022 fue debido a varios factores, siendo de gran impacto el fenómeno migratorio. La tasa de migración en Venezuela muestra tendencia negativa lo que indica que el país pierde población.

Objective Describe the current state of the regulatory framework for migration and the trend of populationand migration indicators in Venezuela for the period2000-2022. Methods: Descriptive study of the regulatory framework for migration and the trend of population andmigration indicators in Venezuela. Sample of national and international documents (regulatory framework). Indicators: total population, demographic dependency rate (total,childhood, elderly) and migration rate. Data sources: health andmigration information platform (regulatory framework) LatinAmerica and the Caribbean Statistical Yearbook 2000 to 2022(population indicators) Results: The regulatory framework formigration in Venezuela is contained in few international andregional laws and agreements. The percentage variation in the Venezuelan population was downward during almost the entireperiod, where even negative values are presented for 2018-2021.The annual rate of population growth showed a constant andmarked decrease from the year 2000 to the year 2018 with highnegative values, then it ascends showing positive values from theyear 2022 with a value equivalent to the year 2000. Conclusions:The migratory legal framework in Venezuela is deficient anddoes not meet the needs of migrants. The changes that haveoccurred in the Venezuelan population from 2000 to 2022 wasdue to several factors, the migratory phenomenon being of greatimpact. the migration rate in Venezuela shows a negative trend,which indicates that the country is losing population.

Plasmodium vivax asociado a virus epstein barr: a propósito de un caso: Hospital Dr. Leopoldo Manrique Terrero" / Plasmodium vivax asociated to epstein barr virus: report of a case

El paludismo aún en nuestros días sigue siendo una enfermedad endémica en ciertos países tropicales, dentro de los cuales se encuentra Venezuela, con una prevalencia relativamente alta, revistiendo gran importancia por su alta morbimortalidad. Se presenta el caso de una adolescente femenina de 12 años de edad, natural y procedente del valle, quien inició enfermedad el 10/02/2001 caracterizada por tos húmeda, congestión nasal y fiebre cuantificada en 38ºC, que cedía parcialmente con la administración de Novalcina. Luego se asocian cafalea difusa predominante en región frontal de moderada intensidad, mialgias y artralgias generalizadas. El 11/02/2001 aparecen lesiones vesiculares en labio superior que se autolomitaron en un período de cuatro días, motivados por los cuales el 14/02/2001 acudió a evaluación en el Servicio de Pediatría del Hospital "Dr Leopoldo Manrique Terrero", en Caracas, encontrándose en los paraclínicos trombocitopenia de 41000, y fue ingresada con el diagnóstico de fiebre dengue. Observando durante su evolución episodios febriles que se prolongan durante trece días de 39ºC a 40ºC. Al practicárcele gota gruesa resultó positiva para plasmodium vivax y el hallazgo en los exámenes complementarios de inmunoglobulina M positiva para virus Epstein barr. Después de iniciar terapia con cloroquina y primaquina se evidencia respuesta adecuado al tratamiento, evolución satisfactoria y egreso

Sindrome mononucleosico por parvovirus / Mononucleosis syndrome by parvovirus

El eritema infeccioso es una enfermedad común en escolares caracterizado por un eritema sobre las mejillas seguido de un metodo reticular en brazos y piernas. Usualmente causa muy poca enfermedad en adolescentes, en quienes algunas veces se manifiesta en asociación a poliartralgias. Se conoce también como " quinta enfermedad". Se presenta el caso de un escolar femenina de 7 años de edad, natural y procedente de la localidad de El Valle, quien inicia enfermedad actual el 27/01/2001 con fiebre cuantificada en 39,5C luego se asocian mialgias y artralgias generalizadas, motivos por los cuales consultó a médico privado quien indicó antipiréticos y controles hematológicos diarios, observando trombocitopenia progresiva. El 31/01/2001, se asocia exantema eritematopapular ascendente y centrífugo que evoluciona a eritrodermia. El 01/02/2001 se asocian vómitos de contenido alimentario, cuantificados en dos, tratados ambulatoriamente con suero oral. El 02/02/2001 presenta decaimiento, trastornos de perfusión y trombocitopenia de 76000, consulta al Hospital Dr. "Leopoldo Manrique Terrero" e ingresa en el área de aislamiento con el diagnóstico de dengue hemorrágico, observando en evolución síndrome febril de trece días de duración, y al cuarto día de enfermedad asociación de síndrome disentérico. Al obtener resultados de exámenes paraclínicos se evidencia infección por parvovirus. Recibió metronidazol penetral durante 7 días, medidas generales de sostén, evoluciona satisfactoriamente y egresa.

Síndrome de Crouzon en adolescente: a propósito de un caso / Crouzon's syndrome in adolescent: a purpose of a case

El síndrome de Crouzon es una disostosis craneofacial poco frecuente que usualmente se diagnostica en etapas precoces de la vida, ya que generalmente estos pacientes no sobreviven hasta la etapa adolescente debido a la hipertensión endocraneana consecutiva al cierre temprano de las suturas, en lo cual radica la importancia de este caso clínico. Se presenta el caso de una adolescente femenina de 11 años de edad, quien acudió a evaluación en el Hospital "Dr. Leopoldo Manrique Terrero", Coche, Caracas, por presentar aumento de volumen con rubor, calor y tumefacción en una mama izquierda y axila derecha, de 14 años de evolución, durante los cuales permaneció afebril, consultó a médico privado quien indicó cefadroxilo 500 mg BID e iboprufeno 400 mg, tratamiento que cumple sin obtener mejoría. El 03-10-2000 fue ingresada en este centro, en el Servicio de Pediatría, Area de Adolescentes, encontrándose al examen físico además de su patología infecciosa, rasgos clínicos de distorsión cráneo facial, por lo cual se realiza una evaluación genética que revela mutación fresca, con cariotipo normal. En discusión del caso en conjunto con el Servicio de Cirugía Plástica se concluye que se trata de un síndrome de Crouzon